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表达序列标签(ESTs)及基因电子克隆

来源:学生作业帮 编辑:灵鹊做题网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/04/28 09:21:54
表达序列标签(ESTs)及基因电子克隆
请问有没有这方面研究比较透彻的先生老师能指点一下.
借助NCBI的BLAST软件可以达到这一目的,将搜索到的高度同源的ESTs进行归类,作为种子库列库,进行序列拼装,构建序列重叠群,再以此重叠群为种子序列重复进行同源搜索、聚类、拼接直至无法再延伸.
表达序列标签(ESTs)及基因电子克隆
就是先有一小段EST序列,用它来Blast特定数据库(如NCBI EST库),将blast结果根据部分重叠区拼接成一个序列,再以这个拼接序列去Blast该数据库,继续将结果拼接成一条序列,如此往复,直到不能blast出更多的序列为止.如果EST库比较全的话,你可以根据一小段EST序列获得整个基因编码序列